鑒于啤酒廢水具有良好的生物可降解性，處理方法主要以生物法為主。由于廢水中含有大量的懸浮物，進入生物處理單元之前需要進行預處理。目前。啤酒廢水的生物處理技術只要有接觸氧化法、SBR法、厭氧-好氧聯合處理技術等。
1     接觸氧化法
接觸氧化法是20世紀80年代國內處理啤酒廢水的主要工藝，由于進水的COD濃度高，一般采用兩級接觸氧化工藝。采用接觸氧化法可以防止高糖含量廢水引起污泥膨脹現象，并且不用投配N、P營養和污泥回流。
2     SBR法
SBR法運行方式靈活，可以根據水質水量的變化調整一個周期的的各個工段的運行時間。由于整個處理過程中缺氧、充氧交替發生，限制了絲狀菌過度繁殖，同時采用限制曝氣方式，增大反應過程中的傳質梯度，故處理效果較為理想。
3     酸化-SBR工藝
這種方法早處理啤酒廢水時，厭氧反應放棄反應時間長、控制條件要求高的甲烷發酵階段，將反應控制在酸化階段，故水解池體積小，不需要收集產生的沼氣，簡化了構造，降低了造價，便于維護，且產生的剩余污泥量少。同時，經水解反應后溶解性COD比例有所增加，有利于微生物對基質的攝取，為后續好氧生物處理創造更為有利的條件。酸化-SBR法處理高濃度啤酒廢水效果比較理想，去除率可以達到95%以上，最高可達99%以上。酸化-SBR法處理中高濃度啤酒廢水時，前置酸化工藝的運行至關主要，酸化效果的好壞直接影響SBR反應器的處理效果，而有機物的去除主要集中在SBR反應器中。酸化-SBR法處理啤酒廢水受進水堿度和反應溫度的影響，最佳溫度是24℃，最佳堿度范圍時500~750mg/L。
4     UASB-好氧接觸氧化工藝
上流式厭氧污泥床能耗低、運行穩定、出水水質好，有效地降低了好樣生化單元的處理負荷和運行能耗。好氧接觸氧化對廢水中的SS和COD均有較高的去除率，這是因為廢水經過厭氧處理后仍含有許多易生物降解的有機物。上流式厭氧污泥床和好氧接觸氧化池相串聯的啤酒廢水處理工藝具有處理效率高、運行穩定、能耗低、容易調試和易于重新啟動等特點。整個工藝對COD的去除率可達95%以上，對懸浮物的去除率高達97%以上。
5     內循環UASB反應器+氧化溝工藝
UASB反應器的出水水質一般都比較穩定，通過內循環回流能提高UASB反應器對進水水溫、pH值和COD濃度的適應能力。后續的氧化溝可以得到優良的出水水質，因此這一組合工藝適合對處理出水水質要求高的場合。此外，內循環UASB反應器可根據啤酒生產的季節性、水質和水量的變化情況實時調整運行參數，能進一步降低運行費用。